A principios de marzo, India se convirtió en el quinto país del mundo en secuenciar el genoma de la novela Coronavirus o Covid- 19 y comparta sus datos con la comunidad internacional.

Instituto Nacional de Virología una institución bajo el Consejo Indio de Investigación Médica el nodal del país El organismo de investigación de salud envió los dos primeros conjuntos de datos a una base de datos abierta compartida por investigadores de todo el mundo.

Los laboratorios, en su mayoría de China, Estados Unidos y los Países Bajos, han contribuido hasta el momento con poco más de 1.100 muestras a la base de datos, que investigadores el mundo puede usar para analizar y trabajar en pruebas, vacunas y medicamentos para combatir la pandemia.

En la India, el primer conjunto de datos del genoma, que detalla el ADN completo del virus, provino de individuos en Kerala que habían contraído el virus. virus.

“El volumen de la muestra y la concentración del virus juegan un papel crucial durante la secuenciación del genoma del virus. En algunas muestras que recibimos, hubo menos concentración de virus y, en el caso de las muestras clínicas, a veces el volumen fue menor. Estos fueron algunos de los desafíos “, dice la profesora Priya Abraham, directora del Instituto Nacional de Virología.

El genoma SARS-CoV2, como se conoce formalmente, tiene alrededor de 30,000 pares de bases, algo así como una cadena larga con 30,000 lugares donde cada uno de estos ocupa uno de los cuatro químicos llamados nucleótidos. Esta larga cadena, con su combinación única de nucleótidos, es lo que identifica de manera única al virus y se llama su secuencia genómica. Para poner esto en contexto, un genoma humano, que es más complejo, tiene 3 mil millones de pares de bases.

Los datos del genoma son esenciales para construir pruebas, encontrar medicamentos y vacunas. También es necesario determinar si ha habido una mutación del virus y cómo afectará a las diferentes poblaciones. También es clave para encontrar medidas para hacer frente a su propagación.

“Necesitamos saber cómo muta el virus, correlacionar la variación de secuencia y su gravedad en los pacientes”, dice el profesor S Vijaya del Departamento de Microbiología y Biología Celular en el Instituto Indio de Ciencia que ha realizado una amplia investigación sobre la tuberculosis y el virus de la encefalitis japonesa.

Los científicos opinan que la India necesita secuenciar más cepas a medida que el virus muta.

“Es importante entender si hay nuevos variantes, ¿por qué un grupo ve pacientes más serios y algunos más leves? Vijaya dice. “En Italia, la tasa de mortalidad es del 10% de los pacientes infectados, en China fue del 2%. Necesitamos aislar cepas que tienen una variación de secuencia que son más patógenas “, agrega.

El nuevo Coronavirus, cuyo huésped inicial se sospecha que es un murciélago, se originó en la provincia de Hubei de China en diciembre pasado.

China fue inicialmente lento para darse cuenta de la magnitud del virus, que afecta los órganos respiratorios. Desde entonces, la enfermedad contagiosa que se propaga a través de las gotas, ya sea a través de la saliva o cuando una persona tose o estornuda, se ha convertido en una pandemia mundial.

Todavía no hay vacuna o medicamento para el brote que ha matado a miles, en gran parte personas con afecciones médicas subyacentes como problemas cardíacos, diabetes y respiratorios.

Hasta ahora, la medida más efectiva ha sido aislar a las personas que dieron positivo, ponerlas en cuarentena y aumentar el distanciamiento social para contener su propagación.

India ha visto la enfermedad ingresa a la tercera fase de propagación de la comunidad: las personas que no han tenido ningún contacto con las personas infectadas y dan positivo por el virus.

El lunes, la Organización Mundial de la Salud advirtió que la pandemia se estaba acelerando.

días para que los casos alcancen la marca de 100,000 en todo el mundo, 11 días para llegar a 200,000 y solo cuatro días para tocar 300,000 casos.

Hasta ahora, más de 6,000 personas en Italia han muerto por el virus, superando a e ven el de China. Más de 16,500 personas han muerto en todo el mundo.

Dada la gravedad del problema y los bloqueos globales en el lugar, India necesita hacer más secuenciación del virus antes de que se propague, dicen los investigadores.

Desde que informó su primer positivo En el caso del 30 de enero, el país ha visto que ese número aumenta a más de 500, y nueve personas han muerto hasta ahora.

“Si hacemos más secuenciación, podemos identificar cuál es la tasa de cambio en el virus, cómo es propagación y la cantidad de virus (en función de sus variaciones) hay en la población “, dice Chitra Pattabiraman, becaria de carrera temprana de la Alianza India en el Departamento de Neurovirología del Instituto Nacional de Salud Mental y Neurociencias (Nimhans) con sede en Bengaluru

Pattabiraman, un virólogo que ha realizado secuenciación del genoma para identificar patógenos en infecciones cerebrales, dice que la secuenciación en las primeras fases de un brote es valiosa porque ayuda a tomar decisiones más rápidas sobre cómo abordar su propagación. [19659003] La India debería secuenciar más cepas para que pueda contribuir a la investigación a nivel mundial, dice.

“Necesitamos desarrollar más capacidad y compartir más cepas con la red global. Siempre hemos utilizado las bases de datos de otras personas para nuestra investigación, esto nos brinda la oportunidad de contribuir a la comunidad mundial “, dice.

El país tiene alrededor de 40 laboratorios, incluidos el Instituto Indio de Ciencia y la Universidad Manipal, que tienen los límites de bioseguridad requeridos (BSL-3) para secuenciar el virus, sin embargo, no ha abierto las muestras a laboratorios fuera de la red ICMR .

“Si se permite que entren más laboratorios. estudiando las cepas, creo que podemos entender mejor el virus “, dice el profesor Vijay Chandru, cofundador de Strand Genomics, que fue uno de los primeros laboratorios privados en recibir permiso para analizar muestras de infecciones por Covid-19.

ICMR es Chandru dice: “mucha gente tiene capacidades, hacer esto bien es importante”.

Disponibilidad de las secuencias indias w cauteloso acerca de abrir más laboratorios para la secuenciación del genoma debido a los estrictos estándares requeridos para extraer las cepas. “Ayudará a comprender la diversidad de las secuencias virales que circulan en el país y sus similitudes con las cepas globales”, dice Abraham de NIV. las empresas se beneficiarían “, dice ella.

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